Можно ли на acer aspire xc-330 dt b9der 003 установить linux debian для медицинс...

Да, нет ни каких припятсвий этому.

Если Вы хотите использовать этот системный блок в качестве сервера базы данных на платформе Debian, то думаю мощностей всё же маловато. Для работы с базой данных лучше использовать серверную аппаратную платформу, при этом следует учитывать максимально допустимое количество одновременно работающих пользователей, пропускную способность местной локалки, использование удалённого доступа и пр. Для более детального анализа Вам следует проконсультироваться со специалистами, обслуживаюшими подобные вашему обекты. Удачи!